riboPOOL 核糖體RNA去除探針試劑盒

riboPOOL 核糖體RNA去除探針試劑盒

riboPOOL 靈活高效的去除核糖體RNA

核糖體RNAs(rRNA)約占RNA-Seq數據讀取量的90%,去除后可大大節省RNA-seq的測序成本。riboPOOL可以高效和特異性地去除rRNAs,適合大多種模式和非模式物種或RNA序列。

riboPOOL 的主要優勢

種類豐富：豐富的成品型目錄可供選擇，目錄持續更新中；目錄以外物種或RNA可以定制

工作流程快：一步法，完整工作流程僅用時70min

起始量范圍廣泛：在100 ng到5μg的RNA起始量之間都有很好的去除效率

針對特殊應用定向優化：ibosome profiling樣本；環境轉錄組學（如土壤、污泥）

高效的去除：去除效率高，結果穩定可重復

搭配靈活：兼容各種RNA純化和RNA建庫方法

探針法：沒有酶切偏好,可以均一的覆蓋轉錄本；無打斷樣本風險；適用于無polyA結構的RNA（如snoRNA,LncRNA, 組蛋白）

兼容多種下游分析方法：如RNA-Seq、微陣列分析和實時定量PCR等

可混合使用：客戶可根據樣本的組成比例，混合使用2-4種riboPOOL，如病原體感染的人體組織（人源+原核通用型）、人血液樣本（人源+人血珠蛋白）、植物微生物群研究（植物通用型+原核通用型）

目錄 成品型 riboPOOLs

riboPOOL 工作流程

ribo POOL 有效起始量范圍(100ng-5ug)

ribo POOL 可混合使用（復合型）

測試樣本為（a）SW48 細胞 (人源), NIH3T3細胞 (小鼠)和DH10B株大腸桿菌RNA混合物。 實驗比較（b）單獨使用人源、鼠源、原核通用型riboPOOL和（c）使用復合型riboPOOL（由1：1：1的人源、鼠 源、原核通用型riboPOOL混合構成），兩者均可有效去除1μg RNA混合樣本中的rRNA. rRNA的去除效率用生物分析儀,或rtqPCR分析評估（用rRNA或GAPDH（管家基因）特異性的引物進行實時定 量PCR ）。

人源/小鼠/大鼠riboPOOLs

可去除細胞質rRNA (28S, 18S, 5.8S & 5S rRNA)&線粒體rRNA

高質量RNA(RIN >7)，rRNA去除效率可達97%-98%

降解RNA/FFPE(RIN<7)，rRNA去除效率可達87%-98%

Ribo-Seq（30nt片段），優化不易去除區域探針密度，rRNA去除效率約75%

*不同實驗方案間有一定差異

riboPOOL的rRNA去除效率高約10%

兩種試劑的可重復性相當

原核通用型（細菌/古生菌）

覆蓋廣泛的原核生物(細菌/古生菌)，適合微生物培養物、宏基因組、微生物組群分析

去除目標涵蓋 5S, 16S and 23S rRNA

原核通用型 riboPOOL設計依據

基于76個代表性物種的rRNAs 序列設 計的微生物通用型 riboPOOL，適合圖 中所示的類群(內圈，粗體)和亞群(外圈) 所涵蓋的細菌和古細菌。

*如果您感興趣的物種不屬于這些類群或亞群，請咨詢我們的定制型riboPOOLs產品。

**譯注:暫無中文譯名

原核通用型 riboPOOL已驗證物種（RNA-Seq ）

測試結果來自不同的實驗室，rRNA去除效率從~50-98%不等，在大多數物種中rRNA去除效率>70% 。去除效率可能因樣品類型和實驗條件的不同而不同。 高質量的RNA樣本中效率高。推薦的起始RNA投放量為100 ng-5 μg。

植物通用型（被子植物）

可去除細胞質(28S, 18S, 5.8S & 5S) 、質體和線粒體 rRNA

廣泛覆蓋開花植物

適合葉片、種子和根等各種組織部位

植物通用型 riboPOOL 可以覆蓋開花植物的主要門類

包括30 多個目（見下圖） 常見物種，如下：

水稻 · 麻瘋樹 · 大豆·土豆 · 棉花 · 咖啡·胡蘿卜 · 洋薊 · 橄欖·擬南芥 · 玉米 · 翠菊·小麥 · 蘋果 · 橙子·蕎麥 · 及其他

*如果您感興趣的物種不屬于這些門類， 請咨詢我們的定制型 riboPOOL產品

植物通用型 riboPOOL的β測試結果

開花植物的去除效率大于91% 值得注意的是，在原始藻類綠藻中rRNA去除效率為80%，表明植物通用型riboPOOL可以應用于被 子植物以外的植物門類。

riboPOOL 核糖體RNA去除探針試劑盒 產品屬性

• 提供兩種產品形式，一種是探針型，另一種是完整試劑盒，兩種形式均提供試驗方案。

• 產品以凍干形式室溫運輸。

• 復溶后，在-20℃或以下的溫度，可穩定保存12個月。建議分裝儲存，避免多次凍融。

訂購信息

請說明訂購的物種名稱（見目錄 成品型），產品種類（探針/試劑盒/定制型），產品規格